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冷冻干燥机进行消毒的工序。常用的消毒方法有：
（1）气体杀菌消毒法 该消毒法是利用气态的或汽化的化学物质来处理设备
或材料，常用消毒剂有：环氧乙烷、甲醛、环氧丙烷、溴代甲烷及 ß 丙醇酸内脂。
（2）加热杀菌法 干加热：利用氧化方法杀死细菌，实际上大部分是焚化了；直接蒸汽加热：采用专门的低压蒸汽消毒蒸锅，要求蒸汽温度保持在 120℃左右，持续时间至少 30 分钟。为了防止蒸汽加热不到死角现象的出现，在通入蒸汽前应将整个系统抽真空至 100Pa。用 70%的酒精在箱内喷雾，经过 24 小时后用消毒布擦干；负压蒸汽加热杀菌剂：将冻干箱和整个系统抽真空至 10Pa 以下，通入 70～90℃的蒸汽加福尔马林溶剂，使容器保持在热状态下 2 小时。
Pilot5-8ES系列经济型冷冻干燥机是为食品、中药材、保健品等物质冷冻干燥处理设计的机型。 箱体内部采用大圆角设计，表面采用镜面抛光，箱体底部采用倾角设计，符合FDA及GMP要求。
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