硅油冻干机按系统分，由制冷系统、真空系统、加热系统、循环系统、压塞系统和控制系统六个主要部分组成。按结构分，由冻干箱或称干燥箱、冷阱或称水汽凝结器、制冷机组、真空机组和阀门、液压机组、循环机组、电气控制元件等组成。
硅油冻干机的工作程序：
1、在冻干之前，把需要冻干的制品分装在合适的容器内，一般是玻璃模子瓶、玻璃管子瓶，装量要均匀，蒸发表面尽量大而厚度尽量薄一些；
2、然后放入与冻干箱板层尺寸相适应的金属盘内。对瓶装一般采用脱底盘，有利于热量的有效传递。
3、装箱之前，先将冻干箱进行空箱降温，然后将制品放入冻干箱内进行预冻；或者将制品放入冻干箱内板层上同时进行预冻；
4、抽真空之前要根据冷阱制冷机的降温速度提前使冷阱工作，抽真空时冷阱至少应达到-40℃的温度；
5、待真空度达到一定数值后(通常应达到13Pa～26Pa内的真空度)，或者有的冻干工艺要求达到所要求的真空度后继续抽真空1～2h以上；即可对箱内制品进行加热。一般加热分两步进行，第一步加温不使制品的温度超过共熔点或称共晶点的温度；待制品内水分基本干完后进行第二步加温，这时可迅速地使制品上升的规定的最高许可温度。在最高许可温度保持2h以上后，即可结束冻干。
整个升华干燥的时间约12～24h左右有的甚至更长，与制品在每瓶内的装量，总装量，玻璃容器的形状、规格，制品的种类，冻干曲线及机器的性能等等有关。
冻干结束后，要充入干燥无菌的空气进入干燥箱，然后尽快地进行加塞封口，以防重新吸收空气中的水分。
在冻干过程中，把制品和板层的温度、冷阱温度和真空度对照时间划成曲线，叫做冻干曲线。一般以温度为纵坐标，时间为横坐标。冻干不同的制品采用不同的冻干曲线。同一制品使用不同的冻干曲线时，制品的质量也不相同，冻干曲线还与冻干机的性能有关。因此不同的制品，不同的冻干机应用不同的冻干曲线。
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